Paaiškinta: kodėl kelių žmonių, kuriems pasireiškia Covid simptomai, testas yra neigiamas?
Daugelio žmonių, turinčių Covid-19 simptomus, testas buvo neigiamas. Yra keletas galimų priežasčių, pavyzdžiui, viruso mutacijos, kurių nepavyksta aptikti, mėginių ėmimo ir tyrimų kokybė bei RT-PGR rinkinių veiksmingumas.
Bandymai gali būti klaidingi įvairiais etapais – nuo netinkamo mėginio paėmimo ir laikymo iki netinkamo ekstrahavimo ir stiprinimo. (Express nuotrauka: Vishal Srivastav) Indijai stengiantis susidoroti su precedento neturinčia RT-PGR tyrimų paklausa, pranešimai rodo, kad iki 20 % simptominių Covid-19 pacientų testas yra neigiamas.
Ši akivaizdi klaidingų neigiamų rezultatų tendencija gali neleisti sunkiems pacientams patekti į ligoninę ir neleisti jiems suteikti kritinės pagalbos, o besimptomiams žmonėms leisti judėti ir platinti virusą. Ši tendencija paskatino ekspertus, įskaitant AIIMS direktorių dr. Randeepą Guleria, rekomenduoti gydymą Covid-19 visiems, kuriems pasireiškia klasikiniai simptomai, nepaisant RT-PGR rezultatų.
Naujienlaiškis| Spustelėkite, kad gautuosiuose gautumėte geriausius dienos paaiškinimus
Kodėl klaidingi negatyvai
RT-PGR testai, laikomi auksiniu standartu diagnozuojant Covid-19, nėra tobuli. Minimalus jautrumas (gebėjimas aptikti teigiamus rezultatus), kurio reikalauja Indijos medicinos tyrimų taryba (ICMR), kad patvirtintų RT-PGR testą, yra 95%. Tai reiškia, kad tikimasi iki 5% klaidingai neigiamų rezultatų.
Nors anekdotiniai pranešimai rodo, kad klaidingai neigiamų rezultatų dalis Indijoje didėja, kol kas nėra tai patvirtinančių tyrimų.
Teoriškai RT-PGR tyrimo tikslumą lemia keturi platūs veiksniai: viruso kiekis asmenyje, mėginių paėmimo ir apdorojimo kokybė, paties tyrimo rinkinio efektyvumas, taip pat testo interpretavimo etalonas.
VIRUSINĖ APkrova: Paprastai Covid-19 tinkamai pasireiškia penktą infekcijos ciklo dieną. Išbandytas kiek anksčiau po kontakto su užsikrėtusiu asmeniu gali pasirodyti neigiamas Covid. Tai gali būti ne pagrindinis veiksnys, nulėmęs pastarojo meto klaidingai neigiamą tendenciją, nes kai kuriems Covid-19 mutantams akivaizdžiai pasireiškia ankstyvi simptomai.
Daugeliui simptominių pacientų, kurių RT-PGR tyrimai buvo klaidingai neigiami, buvo patvirtintas Covid teigiamas bronchų alveolinio plovimo (BAL) testų, kurių metu per bronchoskopą renkami mėginiai iš apatinių kvėpavimo takų, rezultatai. Tai paskatino spėlioti, kad tam tikri mutantai apeina viršutinius kvėpavimo takus, kad būtų nukreipti į plaučius – scenarijus, kuris gali paneigti RT-PGR tyrimą, pagrįstą mėginiu, paimtu iš nosies ertmės ir gerklės, viruso kiekiu, reikalingu norint gauti tikslų rezultatą.
rick kaepernick grynoji vertė
GALIMYBĖS SPROGIMAS: „Covid“ bandymų laboratorijų skaičius Indijoje išaugo nuo 14 2020 m. vasario mėn. iki daugiau nei 2 400 2021 m. balandžio mėn. Dėl tokio spartaus išplėtimo reikėjo patvirtinti šimtus laboratorijų RT-PGR bandymams atlikti ir skubiai apmokyti tūkstančius technikų.
Kaip apsaugos priemonė 2020 m. liepos mėn. ICMR išvardijo 30 kokybės kontrolės laboratorijų, kad patikrintų visas patvirtintas „Covid“ laboratorijas. Nuo tada buvo pridėtos dar 8 QC laboratorijos. Tačiau šaltiniai keliose laboratorijose trijose valstijose teigė, kad buvo atlikta tik keletas įrenginių ir prietaisų patikrinimų.
Idealiu atveju teigiamų ir neigiamų mėginių mišinys turėtų būti periodiškai paimtas iš kiekvienos laboratorijos pakartotiniam tyrimui. Ar tai kada nors buvo padaryta? Taip. Ar tai buvo daroma nuosekliai? Ne, sakė ICMR instituto mokslininkas, neturintis teisės kalbėti su žiniasklaida.
Nuo 2020 m. liepos mėn. ICMR ir daugelis QC laboratorijų, dėl kurių buvo kreiptasi dėl periodinės laboratorijos stebėjimo ir kokybės atitikties duomenų, tylėjo.
ŽMOGUS ELEMENTAS: Bandymai gali būti klaidingi įvairiais etapais – nuo blogo mėginių paėmimo ir laikymo iki netinkamo ekstrahavimo ir stiprinimo. Visuose RT-PGR rinkiniuose yra vidinė kontrolė (IC), apsauganti nuo scenarijaus, kai nėra išgaunama/neamplifikuojama RNR ir gaunamas klaidingas neigiamas rezultatas. IC gali būti egzogeninis arba endogeninis. Tai yra egzogeninė, kai dirbtinė RNR šablono molekulė pridedama prie kiekvieno mėginio prieš RNR ekstrakciją. Tyrimas laikomas negaliojančiu, jei po ekstrahavimo sintetinė RNR neaptinkama ir paskiriamas pakartotinis tyrimas. Be to, endogeninei kontrolei naudojamas žmogaus „namų tvarkymo“ genas, esantis mėginyje; jo neaptikimas po RNR ekstrahavimo procedūros daro testą negaliojantį.
Žmogaus namų priežiūros genas taip pat užtikrina mėginio kokybę... Tačiau daugiau nei 75% RT-PGR rinkinių Indijos rinkoje naudoja pigesnes išorines vidines kontrolę, sakė Mumbajuje dirbantis molekulinis biologas.
ICMR 2020 m. balandžio mėn. SOP dėl RT-PGR teigiama, kad į egzogeninę ekstrahavimo kontrolę galima nepaisyti, nes ji neatspindės paimto mėginio kokybės. Rekomendavo, kad atskiras RNazė P arba bet kuris kitas žmogaus namų ūkio genas… turėtų būti paleistas lygiagrečiai atskirame mėgintuvėlyje… (siekiant patikrinti paimto mėginio kokybę ir ekstrahavimo procedūrą).
2020 m. gegužės mėn. ICMR/HLL paskelbtame dideliame konkurse dėl RT-PGR rinkinių buvo nurodyti panašūs reikalavimai. Daugelis gamintojų tvirtino, kad skirtingos įmonės taiko skirtingą vidaus kontrolę, įskaitant išorines, kurias patvirtino reguliavimo agentūros, tokios kaip FDA ir CEIVD, ir kad nepalanki atranka, pagrįsta namų priežiūros genais, atgrasytų sąžiningą konkurenciją. Galiausiai konkursas buvo peržiūrėtas, įtraukiant tiek endogenines, tiek išorines vidaus kontrolės galimybes.
VIRUSINĖ MUTACIJA: RTR-PGR testas skirtas tam tikrai vieno ar daugiau viruso genų sričiai, kad būtų galima nustatyti jo buvimą. Bandymas gali pateikti klaidingai neigiamus rezultatus, jei vertinamame genomo segmente įvyksta mutacija. Testai, kuriuose naudojami keli genetiniai taikiniai, pavyzdžiui, Indijoje, yra mažiau tikėtina, kad juos suklaidins mutacijos.
kiek yra vertas Džordžas Lopezas
Reguliavimo institucijos, tokios kaip JAV FDA, reguliariai stebi mutacijų poveikį RT-PGR tyrimams Nors ekspertai, tokie kaip Dr. Rakesh Mishra, Haidarabado ląstelių ir molekulinės biologijos centro (CCMB) direktorius, mano, kad ICMR turėtų inicijuoti panašų pratimą, tai gali būti ne Lengva stebėti realiu laiku daugiau nei 200 Indijoje patvirtintų RT-PGR rinkinių, apsaugančių nuo atsirandančių mutacijų.
Viena vertus, joks gamintojas nepaskelbė (ar nepaskelbė) išsamių sekų, kuriomis siekiama atlikti bandymus. Teikdami patvirtinimą ICMR, jie mini tik tikslinius genus, o ne pradmenų seką, sakė Sveikatos apsaugos ministerijos vyresnysis mokslo darbuotojas.
Tačiau iki šiol galima jaustis gana pasitikinčiais, net jei nėra jokio veiksmingumo patikrinimo realiuoju laiku. Iki šiol Covid-19 variantai daugiausia turi S geno (smailės baltymo) mutacijų. Daugumoje rinkinių čia naudojami konservuoti (nepakitę) taikinių regionai, sakė dr. Shanta Dutta, Nacionalinio choleros ir enterinių ligų instituto (NICED) direktorius Kolkatoje.
Kainų kritimas
Per vienerius metus RT-PGR rinkinio kaina sumažėjo nuo daugiau nei 1 100 rupijų iki mažiau nei 40 rupijų. 2020 m. spalio mėn. atleidimas nuo importo muito buvo panaikintas, todėl dauguma užsienio prekių ženklų paliko Indijos rinką dėl papildomos 15 % išlaidų naštos. Nemažai Indijos prekių ženklų taip pat atsisakė parduoti už mažesnę nei 100 rupijų kainą. Daugelis rado atsidavusių įmonių klientų, kurie neprieštarauja mokėti šiek tiek daugiau, kad užtikrintų kokybę. Kai kurie netgi siūlo kelis PGR rinkinius skirtingais kainų lygiais.
Nors niekas to nesako, daugelis abejoja pigesnės konkurencijos kokybe. Priešingai, kiekvienas rinkoje esantis bandymų rinkinys atitinka ICMR patvirtinimo kriterijus ir kad bet koks kainų karas galiausiai yra naudingas vartotojui.
Tačiau ne visi yra įsitikinę. Atitinkamai laboratorinio tyrimo kaina sumažėjo nuo 4 500 rupijų iki 800 rupijų. Be to, ar žmogus, apsilankęs jos vietinėje laboratorijoje atlikti Covid testą, žino, kuris rinkinys yra naudojamas? Kiek laboratorijų išleis 100 Rs, kai galės išsisukti naudodami 40 Rs rinkinį? sakė vienas pirmųjų Indijos Covid PGR rinkinių gamintojų.
PRISIJUNK DABAR :„Explained Telegram“ kanalas
The Ct vertė
RT-PGR testas amplifikuoja iš mėginio išskirtą nukleino rūgštį, kad būtų galima nustatyti specifinę Covid-19 virusui. Stiprinimas vyksta ciklais su slenksčio (Ct) reikšme. Akivaizdu, kad kuo didesnis viruso buvimas / apkrova, tuo mažesnė Ct vertė arba amplifikacijos ciklų skaičius, reikalingas jį aptikti.
ICMR nustatė 35 Ct reikšmę neigiamiems rezultatams. Be to, bet koks galimas viruso pėdsakas laikomas nereikšmingu, o mėginys laikomas Covid neigiamu.
Tačiau tam tikros valstijos, pvz., Maharaštra, siekė išplėsti leistinumo ribą, siūlydamos 24 Ct vertę. Kadangi tai potencialiai pašalintų daug žmonių, turinčių kiekybiškai mažesnį, bet kliniškai reikšmingą virusų kiekį, ICMR pakartojo savo poziciją dėl 35 Ct vertės. .
Tačiau yra mažai aiškumo, jei visos valstybės laikosi to paties Ct etalono. Pasak mažiausiai dviejų daugiašalių laboratorijų tinklų vyresniųjų vadovų, jie gavo prieštaringus ir kartais nepagrįstus žodinius nurodymus dėl tokių bandymų parametrų. Net molekulinis testas nėra apsaugotas nuo subjektyvaus šališkumo.
Dalykitės Su Savo Draugais:
