Paaiškinta: kaip veikia koronaviruso (COVID-19) testas

Kaip PGR testas ieško viruso tamponų mėginiuose? Kiek tai užtruks? Kiek mėginių Indija tikrina kasdien ir ar gali išbandyti daugiau? Jei gali, kodėl ji dar nepadidinta?

Šiuo metu Indija atlieka dviejų etapų realaus laiko PGR, kad patikrintų SARS-COV-2. („Reuters“)

Koks yra naujojo koronaviruso, sukeliančio COVID-19, diagnostikos testas?

The Indijos medicinos tyrimų taryba (ICMR) nurodė paskirtas laboratorijas naudos įprastą realaus laiko polimerazės grandininės reakcijos (PGR) testą, kuris atliekamas su tamponu, paimtu iš užpakalinės gerklės, skysto mėginio iš apatinių kvėpavimo takų arba paprastu seilių mėginiu. Tokie testai dažniausiai naudojami nustatant gripo A, B ir H1N1 virusus.

Kas yra PGR testas?

Jis naudoja techniką, kuri sukuria DNR segmento kopijas. „Polimerazė“ reiškia fermentus, kurie sukuria DNR kopijas. „Grandininė reakcija“ yra tai, kaip DNR fragmentai kopijuojami eksponentiškai – vienas nukopijuojamas į du, du – į keturis ir pan. Kary Mullis, amerikiečių biochemikas, išradęs PGR techniką, 1993 m. buvo apdovanotas Nobelio chemijos premija.

Tačiau SARS-COV-2 yra virusas, sudarytas iš RNR, kurią reikia paversti DNR. Šiuo tikslu ši technika apima procesą, vadinamą atvirkštine transkripcija. „Atvirkštinės transkriptazės“ fermentas paverčia RNR į DNR. Tada daromos ir amplifikuojamos DNR kopijos. Fluorescencinis DNR surišantis dažiklis, vadinamas zondu, rodo viruso buvimą. Testas taip pat išskiria SARS-COV-2 nuo kitų virusų.

Kiek laiko trunka PGR procesas?

Realaus laiko PGR sumažino mėginių tyrimo laiką iki 4,5 valandos, palyginti su maždaug 6 valandomis anksčiau, sakė ICMR mokslininkas dr. R. R. Gangakhedkaras. Tačiau bendras apyvartos laikas – nuo ​​mėginių paėmimo iki ataskaitos pateikimo – yra maždaug 24 valandos ir turėtų būti trumpesnis, sakė jis.

Paaiškinta: Penki žingsniai norint aptikti koronavirusą

Kaip bandymas atliekamas Indijoje?

Šiuo metu Indija atlieka dviejų etapų realaus laiko PGR, kad patikrintų SARS-COV-2, sakė NIMHANS vyresnysis profesorius ir neurovirologijos vadovas dr. V Ravi. Pirmasis etapas skirtas aptikti genetinius elementus, bendrus žmogaus koronavirusams, kurie gali egzistuoti mėginyje. Antrasis etapas skirtas tirti specifinius genus, esančius tik SARS-COV-2 viruse.

Iki kovo pradžios, pradinis patikrinimas testas, skirtas patikrinti, ar nėra bet kokio tipo koronaviruso, buvo atliktas visose laboratorijose, tačiau patvirtinamąjį PGR atliko tik Nacionalinis virusologijos institutas Pune. Tada NIV Pune perdavė technologiją (reagentus, reikalingus patvirtinimui) į visas laboratorijas, kad nereikėtų mėginio nukeliauti iki Punos. Tai sutrumpino mėginių tyrimo laiką, sakė dr Ravi.

Koronaviruso tyrimas: mėgintuvėliuose, pažymėtuose koronavirusu (COVID-19), matomas netikras kraujas šioje iliustracijoje, darytoje 2020 m. kovo 17 d. (Reuters iliustracija: Dado RuvicO

Ar Indija išbando pakankamai skaičių?

Indija gali kasdien ištirti 10 000 mėginių, o šiuo metu tiriama apie 600–700. Palyginimui, Pietų Korėja, kurios apyvartos laikas yra panašus, per dieną ištiria iki 20 000 mėginių, ypač naudodama tokius modelius kaip bandymų įranga.

Vyriausybė teigia, kad šiame etape nebūtina išbandyti kiekvieno žmogaus. Šalis išbando grupę, kurią jai dabar reikia išbandyti, sakė dr. Gangakhedkaras. Jei naudojate lokalizuotą perdavimą, mes pakankamai išbandome. Jei manote, kad perdavimas yra bendruomenės pagrindu, tai yra kita problema. Jis sakė, kad vis dar nėra įrodymų, kad mes nežinome, kaip indekso atvejis įgijo šią infekciją.

erica mena grynoji vertė

„Explained“ dabar yra „Telegram“. Spustelėkite čia norėdami prisijungti prie mūsų kanalo (@ieexplained) ir gaukite naujausią informaciją

Nenorime atlikti jokių beatodairiškų testų, nes dabar visi prašo testo. Taigi, kažkur turėsime tai racionalizuoti... bet taip pat svarbu stebėti, kad nepraleistume bendruomenės perdavimo, praėjusią savaitę per spaudos konferenciją sakė ICMR mokslininkė dr. Nivedita Gupta.

fermos grynoji vertė

Kokia bus strategija, jei įvyks bendruomenės perdavimas?

ICMR atlieka bet kokių bendruomenės perdavimo požymių stebėjimą, o kiekvienoje iš 52 Indijos tyrimų laboratorijų tiriama 20 atsitiktinių pacientų, sergančių sunkia ūmia kvėpavimo takų infekcija (SARI), mėginių. Tikimasi, kad „pirmasis šių bandymų etapas“ bus paskelbtas trečiadienį. ICMR teigė, kad tuo atveju, jei iš šių stebėjimo testų bus atskleistas bendruomenės perdavimo atvejis, vyriausybės strategijos bus visiškai kitokios.

Koronaviruso pandemija: ligoninėje Naujajame Delyje. (PTI nuotrauka / failas)

Ar yra kliūčių išplėsti testavimą?

Kai kurie ekspertai mano, kad kaina yra potenciali kliūtis. ICMR pareigūnai konferencijoje sakė, kad pirminio tyrimo dėl COVID-19 kaina yra 1500 rupijų. Jei reikia atlikti antrą bandymą, kad būtų patvirtinti pirmojo tyrimo rezultatai, bendra kaina yra apie 5000 rupijų. Vienas iš pareigūnų taip pat buvo sakęs, kad naudojami zondai, importuoti iš Vokietijos, yra ribojantis veiksnys.

Padidinus tyrimų centrų skaičių, išaugo ir zondų importas. Praėjusią savaitę Indija norėjo importuoti apie 200 000 zondų, o pirmadienį daktaras Gangakhedkaras sakė, kad vyriausybė planuoja importuoti apie milijoną.

Koronaviruso pandemija: kada ir kam atlikti tyrimą

Ar Indija galėtų elgtis kitaip?

Indijos Translational Health mokslo ir technologijų instituto vykdomasis direktorius dr. Tačiau į šalį atvykstančių asmenų ištyrimas ir stebėjimas bei asmenų, su kuriais jie kontaktavo, stebėjimas yra racionalus ir tinkamas būdas, jei vienintelė rizika buvo ligos įvežimas, o stebėjimas ir tyrimai buvo 100 %, Ji pasakė.

Tačiau gali nutikti taip, kad užsikrėtus šia infekcija galite išplisti net prieš pasireiškus simptomams, o labai retais atvejais simptomai gali ir nepasireikšti, todėl galite perduoti ją kitiems žmonėms nežinodami, kad esate užsikrėtę, sakė ji. Dėl tokio sudėtingumo reikia pagalvoti apie atsarginę strategiją, kad pamatytumėte, ar iš tikrųjų ko nors nepraleidote, sakė ji. Yra ir daugiau, ką galėtume padaryti.

Ar ICMR stebėjimas padės?

ICMR sprendimas yra geras žingsnis, tačiau yra regionų, kurių tokios pratybos būtų neįtrauktos, sakė dr. Kangas. Jei kiekvieną savaitę tiriate mėginius iš kiekvienos gripo laboratorijos, tada, jei rasite nors vieną teigiamą rezultatą, tai jums pasakys, kad daug ką praleidote, sakė ji.

Pasak daktaro Kango, galima naudoti matematinį modeliavimą, kad suprastų, kas suteiktų vyriausybei pagrįstą galimybę nustatyti, ar jau yra koks nors bendruomenės perdavimas. Manau, būtų puiku turėti tokį modelį, kokį turi Singapūre, kai bet kuriam gydytojui, kuriam kilo klinikinis įtarimas, net jei jis neatitiko aprašymo, būtų leista siųsti savo pacientą tyrimui, pridūrė ji.

– Kauno šerifo M

Dalykitės Su Savo Draugais: