Paaiškinta: kaip greitai plinta nauja koronaviruso atmaina? Ar tai turės įtakos vakcinacijai?

Nauja koronaviruso atmaina JK: Indija ir kelios kitos šalys sustabdė skrydžius į JK ir iš jos. Kokios mutacijos lėmė nerimą keliantį koronaviruso variantą? Kaip greitai jis išplito? Ir ar tai turės įtakos vakcinacijai?

2020 m. gruodžio 21 d. Cointrin oro uoste, Ženevoje, Šveicarijoje, atšaukti skrydžiai iš Didžiosios Britanijos. („Reuters“ nuotrauka: Denis Balibouse)

Pirmadienį Indija sustabdė visus skrydžius iš ir į JK iki gruodžio 31 d., kylant susirūpinimui dėl a naujas variantas SARS-CoV-2, kuris ten plinta ir sparčiai auga. Kelios kitos šalys taip pat sustabdė JK skrydžius ir įvedė kelionių apribojimus.

Kokie yra šie rūpesčiai, dėl kurių ribojami kelionės?

Praėjusią savaitę paaiškėjo, kad naujasis SARS-CoV-2 variantas yra greito Covid-19 atvejų padidėjimo Pietų ir Rytų Anglijoje priežastis. Jis vadinamas VUI (tiriamas variantas) 202012/01 arba B.1.1.7 linija.

Per pastarąsias kelias dienas dėl savo pasaulinio lygio genominių galimybių nustatėme naują koronaviruso atmaina, kuri gali būti siejama su spartesniu plitimu Pietų Anglijoje, JK sveikatos sekretorius Mattas Hancockas sakė Bendruomenių rūmams. Gruodžio 14 d. JK valdžia apie variantą jau pranešė Pasaulio sveikatos organizacijai.

Anglijos visuomenės sveikatos tarnyba (PHE) paskelbė, kad gruodžio 13 d. buvo nustatyti 1 108 šio varianto atvejai, daugiausia Pietų ir Rytų Anglijoje. PHE bendradarbiauja su partneriais, kad ištirtų, ir planuoja pasidalinti savo išvadomis per ateinančias 2 savaites.

keanu reeves gyvenimo būdas

Koks variantas?

Variantą genomo stebėjimo metu nustatė COVID-19 Genomics UK (COG-UK), konsorciumas, analizuojantis JK genomo sekos nustatymo duomenis. COG-UK yra didžiausias pasaulinės Covid-19 duomenų bazės GISAID dalyvis.

Variantas atsirado dėl daugybės naujojo koronaviruso SARS-CoV-2 smaigalio baltymo mutacijų, taip pat mutacijų kituose RNR viruso genominiuose regionuose. Preliminari analizė rodo, kad jis yra labiau užkrečiamas nei anksčiau cirkuliuojantys variantai. COG-UK identifikavo vieną iš šių mutacijų kaip N501Y, smailės baltymo srityje, kuri jungiasi su pagrindiniu žmogaus ląstelės baltymu – ACE2 receptoriumi. Tai buvo požymis, kad dėl pakitimų teoriškai virusas gali tapti labiau užkrečiamas. Konsorciumas teigė, kad dedamos pastangos patvirtinti, ar kuri nors iš šių mutacijų prisideda prie padidėjusio perdavimo.

Ką iki šiol žinome apie užkrečiamumą ir ligos sunkumą?

Sekmadienį PHE teigė, kad viso genomo sekos nustatymo, epidemiologijos ir modeliavimo duomenys rodo, kad naujasis variantas perduodamas lengviau nei kitos padermės.

Tačiau ji taip pat pabrėžė, kad nėra įrodymų, kad variantas labiau linkęs sukelti sunkią ligą ar mirtį. … Bet mes tęsiame tyrimus, kad tai geriau suprastume, sakoma jame. Ji teigė, kad mirtingumas yra vėluojantis rodiklis ir artimiausiomis savaitėmis ji nuolat tai stebės.

PHE teigė dar nežinanti šio perdavimo padidėjimo mechanizmo. Žinome, kad spygliuočių baltymo, viruso dalies, dėl kurios jis tampa užkrečiamas, mutacijos gali pakeisti viruso sąveiką su žmogaus ląstelėmis.

Teigiama, kad įrodymai rodo, kad užkrėtimo dažnis geografinėse vietovėse, kuriose cirkuliavo ši konkreti padermė, išaugo greičiau nei tikėtasi, o modeliavimo įrodymai parodė, kad šio varianto perdavimo greitis didesnis nei kitų dabartinės apyvartos variantų.

Nauja koronaviruso atmaina JK: policijos pareigūnas nukreipia eismą prie įėjimo į uždarytą keltų terminalą Doveryje, Anglijoje, pirmadienį, uždarius Doverio uostą. (AP nuotrauka)

Kiek susirūpinimą kelia didesnis užkrečiamumas?

Gruodžio 18 d. Naujų ir naujų kvėpavimo takų virusų grėsmių patarėjų grupė (NERVTAG), konsultuojanti JK vyriausybę dėl naujų ir atsirandančių kvėpavimo takų virusų keliamos grėsmės, teigė, kad naujasis variantas gali padidinti ligos reprodukcijos skaičių iki 0,93 karto. . Jame teigiama, kad ji turi vidutinį pasitikėjimą, kad naujasis variantas, palyginti su kitais variantais, žymiai padidina pralaidumą.

Tačiau ekspertų institucija padarė išvadą, kad šiuo metu nėra pakankamai duomenų, kad būtų galima padaryti išvadas apie pagrindinį padidėjusio užkrečiamumo mechanizmą, atvejų pasiskirstymą pagal amžių ir ligos sunkumą. Teigiama, kad buvo nustatytos 4 mirtys iš maždaug 1000 atvejų, tačiau reikia toliau dirbti, kad šis mirtingumas būtų lyginamas su palyginamų duomenų rinkiniais.

Mutacijų vieta glikoproteino smaigalio receptorius surišančiame domene padidina galimybę, kad šis variantas antigeniškai skiriasi nuo ankstesnių variantų. Buvo nustatytos keturios galimos pakartotinio užsikrėtimo atvejai tarp 915 tiriamųjų, turinčių šį variantą, tačiau reikia toliau dirbti, kad šis pakartotinio užsikrėtimo dažnis būtų lyginamas su panašiais duomenų rinkiniais.

Sekmadienį Europos ligų prevencijos ir kontrolės centro paskelbtoje grėsmės vertinimo santraukoje teigiama, kad filogenetinė analizė rodo, kad klasteris skiriasi nuo pradinės Wuhan padermės 29 nukleotidų pakaitalais. Trys sekos iš Danijos ir viena iš Australijos, iš mėginių, paimtų 2020 m. lapkritį, susideda iš JK varianto, o tai greičiausiai rodo, kad įvyko tarptautinis paplitimas, nors mastas vis dar nežinomas.

Nauja koronaviruso atmaina JK: Doverio uostas uždaromas ES šalims įvedus draudimą keliauti iš JK. („Reuters“ nuotrauka)

Bet ar virusas nebuvo mutavęs anksčiau?

Kai virusas dauginasi ir cirkuliuoja žmonių populiacijoje, mutacijos vyksta natūraliai, maždaug nuo vienos iki dviejų mutacijų per mėnesį pasaulinėje filogenezėje.

Tiesą sakant, COG-UK teigia, kad SARS-CoV-2 atveju šiuo metu yra apie 4000 smailių baltymų mutacijų. Variantas D614G anksčiau buvo dominuojantis štamas, nes jis plito labai lengvai. Kita padermė, kilusi iš Ispanijos ūkininkų, 20A. EU1, vasarą greitai išplito visoje Europoje.

kiek verta žvėris

Sunku numatyti, ar kuri nors mutacija yra svarbi, kai ji pirmą kartą atsiranda, atsižvelgiant į nuolatinį naujų mutacijų atsiradimą. Suprasti jų reikšmę gali būti įmanoma remiantis eksperimentiniu darbu, kuris rodo ryšį tarp mutacijos ir subtilių viruso biologijos pokyčių. Tačiau norint patikrinti daugelio tūkstančių mutacijų derinių poveikį, prireiktų daug laiko ir pastangų, teigė COG-UK.

Ar tai turės įtakos vakcinos kūrimui ir atsakui?

Sekmadienį JK valdžios institucijos pranešė, kad norint tai suprasti, pirmenybė teikiama tolesniam laboratoriniam darbui. Šiuo metu nėra įrodymų, kad Pfizer vakcina neapsaugos žmonių nuo naujos padermės, sakė PHE.

Dalykitės Su Savo Draugais: